Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snu13Q9D0T1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms