Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem88Q9D0N8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms