Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gtf2e1Q9D0D5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms