Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp3Q9D032 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms