Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CXL3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CXL3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CXL3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CXL3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CXL3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CXL3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CXL3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CXL3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CXL3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CXL3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CXL3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CXL3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms