Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed5Q9CXE7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed5Q9CXE7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 477.4 ms