Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms