Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms