Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pin4Q9CWW6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pin4Q9CWW6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 563.7 ms