Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BccipQ9CWI3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms