Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Sycp2Q9CUU3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Sycp2Q9CUU3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms