Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms