Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN5

Six6os1, Protein SIX6OS1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6os1Q9CTN5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Six6os1Q9CTN5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Six6os1Q9CTN5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms