Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CRC3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CRC3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CRC3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CRC3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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