Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cox16Q9CR63 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cox16Q9CR63 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cox16Q9CR63 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cox16Q9CR63 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cox16Q9CR63 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cox16Q9CR63 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cox16Q9CR63 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cox16Q9CR63 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms