Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NmbQ9CR53 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms