Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl28Q9CR40 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms