Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc43Q9CR29 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc43Q9CR29 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms