Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQM1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQM1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQM1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQM1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQM1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQM1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQM1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQM1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQM1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQM1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CQM1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms