Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed6Q9CQG0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmed6Q9CQG0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tmed6Q9CQG0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tmed6Q9CQG0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tmed6Q9CQG0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmed6Q9CQG0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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