Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atp6v0e1Q9CQD8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atp6v0e1Q9CQD8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atp6v0e1Q9CQD8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atp6v0e1Q9CQD8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Atp6v0e1Q9CQD8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Atp6v0e1Q9CQD8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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