Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkp2Q9CQ73 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms