Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncbp2Q9CQ49 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncbp2Q9CQ49 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms