Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc198Q9CPZ1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms