Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg3Q9CPX6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg3Q9CPX6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms