Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bap1Q99PU7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms