Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim26Q99PN3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim26Q99PN3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms