Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2a1Q99PM3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2a1Q99PM3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2a1Q99PM3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms