Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim8Q99PJ2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim8Q99PJ2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms