Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b1Q99NB9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b1Q99NB9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sf3b1Q99NB9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms