Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pcgf6Q99NA9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcgf6Q99NA9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms