Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Atoh8Q99NA2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms