Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gins4Q99LZ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms