Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pagr1aQ99L02 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pagr1aQ99L02 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms