Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms