Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ciao1Q99KN2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms