Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab28Q99KL7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab28Q99KL7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab28Q99KL7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms