Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Reep3Q99KK1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Reep3Q99KK1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms