Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hps4Q99KG7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps4Q99KG7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps4Q99KG7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms