Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Me2Q99KE1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Me2Q99KE1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Me2Q99KE1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms