Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TrabdQ99JY4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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