Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EpcamQ99JW5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EpcamQ99JW5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms