Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms