Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apobec3Q99J72 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms