Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan1Q99J59 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan1Q99J59 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tspan1Q99J59 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan1Q99J59 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan1Q99J59 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan1Q99J59 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms