Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctu1Q99J10 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms