Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc8b1Q925Q3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8b1Q925Q3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc8b1Q925Q3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms