Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Lmo1Q924W9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo1Q924W9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lmo1Q924W9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lmo1Q924W9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lmo1Q924W9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lmo1Q924W9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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