Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf3Q922U1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms