Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca5Q91ZW3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarca5Q91ZW3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms